Tuvieron problemas en el camino, ya que las penalidades que se imponían en el terreno tuvieron que construir una barcaza donde un personaje llamado francisco de Orellana descendió por el rio amazona en busca de mas provisiones, lo cual Orellana nunca volvió.
Gracias a esto Gonzalo tuvo que tomar la decisión de seguir la expedición y se regresa a Quito, en junio de 1542 vuelven a Quito más de la mitad de los indios murieron y solo llegaron 80 españoles.